Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNW5

GDPGP1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPGP1Q6ZNW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPGP1Q6ZNW5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPGP1Q6ZNW5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms