Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ3

CD300LD, CMRF35-like molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LDQ6UXZ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD300LDQ6UXZ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD300LDQ6UXZ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD300LDQ6UXZ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD300LDQ6UXZ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD300LDQ6UXZ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD300LDQ6UXZ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD300LDQ6UXZ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD300LDQ6UXZ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD300LDQ6UXZ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD300LDQ6UXZ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD300LDQ6UXZ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD300LDQ6UXZ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD300LDQ6UXZ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD300LDQ6UXZ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD300LDQ6UXZ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD300LDQ6UXZ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD300LDQ6UXZ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD300LDQ6UXZ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD300LDQ6UXZ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD300LDQ6UXZ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD300LDQ6UXZ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD300LDQ6UXZ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD300LDQ6UXZ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD300LDQ6UXZ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD300LDQ6UXZ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD300LDQ6UXZ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms