Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXU4

GSG1L, Germ cell-specific gene 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1LQ6UXU4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSG1LQ6UXU4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1LQ6UXU4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1LQ6UXU4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1LQ6UXU4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1LQ6UXU4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms