Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCBE1Q6UXH8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCBE1Q6UXH8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCBE1Q6UXH8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCBE1Q6UXH8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCBE1Q6UXH8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCBE1Q6UXH8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCBE1Q6UXH8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCBE1Q6UXH8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCBE1Q6UXH8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCBE1Q6UXH8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCBE1Q6UXH8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCBE1Q6UXH8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCBE1Q6UXH8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms