Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6Q795 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6Q795 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6Q795 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6Q795 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6Q795 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6Q795 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6Q795 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6Q795 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6Q795 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6Q795 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6Q795 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6Q795 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6Q795 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6Q795 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6Q795 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6Q795 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6Q795 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6Q795 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6Q795 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6Q795 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6Q795 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6Q795 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6Q795 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6Q795 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6Q795 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6Q795 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6Q795 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6Q795 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6Q795 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6Q795 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6Q795 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6Q795 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6Q795 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6Q795 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6Q795 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6Q795 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6Q795 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6Q795 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6Q795 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6Q795 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6Q795 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6Q795 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6Q795 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6Q795 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6Q795 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6Q795 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6Q795 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6Q795 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6Q795 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6Q795 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6Q795 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6Q795 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6Q795 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6Q795 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6Q795 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6Q795 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6Q795 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6Q795 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6Q795 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6Q795 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6Q795 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6Q795 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6Q795 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6Q795 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6Q795 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6Q795 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6Q795 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6Q795 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6Q795 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6Q795 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6Q795 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6Q795 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6Q795 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6Q795 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6Q795 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6Q795 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6Q795 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6Q795 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6Q795 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6Q795 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6Q795 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6Q795 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6Q795 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6Q795 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6Q795 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6Q795 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6Q795 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6Q795 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6Q795 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6Q795 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6Q795 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6Q795 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6Q795 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6Q795 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6Q795 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6Q795 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6Q795 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6Q795 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6Q795 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms