Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNDC11Q6PKC3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNDC11Q6PKC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNDC11Q6PKC3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNDC11Q6PKC3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNDC11Q6PKC3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNDC11Q6PKC3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNDC11Q6PKC3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNDC11Q6PKC3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNDC11Q6PKC3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TXNDC11Q6PKC3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TXNDC11Q6PKC3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNDC11Q6PKC3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC11Q6PKC3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC11Q6PKC3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms