Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP4Q6PIL6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP4Q6PIL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNIP4Q6PIL6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms