Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf88Q6PI97 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf88Q6PI97 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf88Q6PI97 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf88Q6PI97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf88Q6PI97 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf88Q6PI97 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf88Q6PI97 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf88Q6PI97 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf88Q6PI97 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf88Q6PI97 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf88Q6PI97 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf88Q6PI97 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms