Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEZ8

PODNL1, Podocan-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODNL1Q6PEZ8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODNL1Q6PEZ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODNL1Q6PEZ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODNL1Q6PEZ8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODNL1Q6PEZ8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODNL1Q6PEZ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PODNL1Q6PEZ8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODNL1Q6PEZ8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODNL1Q6PEZ8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODNL1Q6PEZ8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODNL1Q6PEZ8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODNL1Q6PEZ8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODNL1Q6PEZ8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODNL1Q6PEZ8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODNL1Q6PEZ8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PODNL1Q6PEZ8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODNL1Q6PEZ8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODNL1Q6PEZ8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 778.2 ms