Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC8BQ6P9F7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8BQ6P9F7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8BQ6P9F7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC8BQ6P9F7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC8BQ6P9F7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRC8BQ6P9F7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC8BQ6P9F7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8BQ6P9F7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC8BQ6P9F7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC8BQ6P9F7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC8BQ6P9F7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC8BQ6P9F7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC8BQ6P9F7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC8BQ6P9F7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.5 ms