Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP3Q6NUK4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REEP3Q6NUK4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REEP3Q6NUK4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REEP3Q6NUK4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP3Q6NUK4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP3Q6NUK4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP3Q6NUK4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REEP3Q6NUK4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REEP3Q6NUK4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REEP3Q6NUK4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
REEP3Q6NUK4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REEP3Q6NUK4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REEP3Q6NUK4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
REEP3Q6NUK4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
REEP3Q6NUK4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
REEP3Q6NUK4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REEP3Q6NUK4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
REEP3Q6NUK4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REEP3Q6NUK4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
REEP3Q6NUK4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REEP3Q6NUK4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REEP3Q6NUK4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms