Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB12Q6IQ22 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB12Q6IQ22 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB12Q6IQ22 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB12Q6IQ22 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB12Q6IQ22 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms