Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYW3Q6IPR3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TYW3Q6IPR3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TYW3Q6IPR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TYW3Q6IPR3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TYW3Q6IPR3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms