Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LARP1BQ659C4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LARP1BQ659C4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LARP1BQ659C4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LARP1BQ659C4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
LARP1BQ659C4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LARP1BQ659C4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LARP1BQ659C4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LARP1BQ659C4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LARP1BQ659C4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LARP1BQ659C4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LARP1BQ659C4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LARP1BQ659C4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LARP1BQ659C4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LARP1BQ659C4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LARP1BQ659C4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LARP1BQ659C4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LARP1BQ659C4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LARP1BQ659C4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LARP1BQ659C4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LARP1BQ659C4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LARP1BQ659C4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LARP1BQ659C4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LARP1BQ659C4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LARP1BQ659C4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LARP1BQ659C4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LARP1BQ659C4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LARP1BQ659C4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LARP1BQ659C4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LARP1BQ659C4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LARP1BQ659C4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LARP1BQ659C4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LARP1BQ659C4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms