Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGNBP1Q5YKI7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGNBP1Q5YKI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGNBP1Q5YKI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGNBP1Q5YKI7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGNBP1Q5YKI7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGNBP1Q5YKI7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGNBP1Q5YKI7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGNBP1Q5YKI7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGNBP1Q5YKI7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGNBP1Q5YKI7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGNBP1Q5YKI7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGNBP1Q5YKI7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGNBP1Q5YKI7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGNBP1Q5YKI7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGNBP1Q5YKI7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGNBP1Q5YKI7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GGNBP1Q5YKI7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms