Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX30Q5VWJ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX30Q5VWJ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX30Q5VWJ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX30Q5VWJ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX30Q5VWJ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX30Q5VWJ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX30Q5VWJ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms