Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCERG1LQ5VWI1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TCERG1LQ5VWI1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCERG1LQ5VWI1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCERG1LQ5VWI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCERG1LQ5VWI1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms