Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF38BQ5VTL8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRPF38BQ5VTL8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRPF38BQ5VTL8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF38BQ5VTL8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF38BQ5VTL8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PRPF38BQ5VTL8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRPF38BQ5VTL8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRPF38BQ5VTL8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPF38BQ5VTL8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF38BQ5VTL8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRPF38BQ5VTL8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRPF38BQ5VTL8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF38BQ5VTL8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF38BQ5VTL8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF38BQ5VTL8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF38BQ5VTL8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF38BQ5VTL8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF38BQ5VTL8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF38BQ5VTL8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRPF38BQ5VTL8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF38BQ5VTL8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF38BQ5VTL8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF38BQ5VTL8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF38BQ5VTL8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF38BQ5VTL8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF38BQ5VTL8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF38BQ5VTL8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF38BQ5VTL8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF38BQ5VTL8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRPF38BQ5VTL8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRPF38BQ5VTL8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPF38BQ5VTL8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRPF38BQ5VTL8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF38BQ5VTL8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF38BQ5VTL8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF38BQ5VTL8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF38BQ5VTL8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms