Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYDE2Q5VT97 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SYDE2Q5VT97 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYDE2Q5VT97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYDE2Q5VT97 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYDE2Q5VT97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYDE2Q5VT97 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYDE2Q5VT97 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYDE2Q5VT97 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYDE2Q5VT97 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYDE2Q5VT97 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYDE2Q5VT97 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYDE2Q5VT97 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYDE2Q5VT97 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYDE2Q5VT97 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYDE2Q5VT97 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYDE2Q5VT97 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYDE2Q5VT97 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYDE2Q5VT97 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYDE2Q5VT97 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYDE2Q5VT97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYDE2Q5VT97 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms