Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGSNQ5TDP6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGSNQ5TDP6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGSNQ5TDP6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGSNQ5TDP6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGSNQ5TDP6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGSNQ5TDP6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGSNQ5TDP6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGSNQ5TDP6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LGSNQ5TDP6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LGSNQ5TDP6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGSNQ5TDP6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGSNQ5TDP6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGSNQ5TDP6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGSNQ5TDP6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LGSNQ5TDP6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGSNQ5TDP6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGSNQ5TDP6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGSNQ5TDP6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGSNQ5TDP6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LGSNQ5TDP6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LGSNQ5TDP6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LGSNQ5TDP6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGSNQ5TDP6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms