Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD3BQ5T9A4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD3BQ5T9A4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD3BQ5T9A4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAD3BQ5T9A4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD3BQ5T9A4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms