Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CAMSAP1Q5T5Y3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CAMSAP1Q5T5Y3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CAMSAP1Q5T5Y3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CAMSAP1Q5T5Y3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CAMSAP1Q5T5Y3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CAMSAP1Q5T5Y3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CAMSAP1Q5T5Y3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CAMSAP1Q5T5Y3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CAMSAP1Q5T5Y3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CAMSAP1Q5T5Y3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CAMSAP1Q5T5Y3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CAMSAP1Q5T5Y3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CAMSAP1Q5T5Y3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CAMSAP1Q5T5Y3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CAMSAP1Q5T5Y3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CAMSAP1Q5T5Y3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CAMSAP1Q5T5Y3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CAMSAP1Q5T5Y3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
CAMSAP1Q5T5Y3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CAMSAP1Q5T5Y3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CAMSAP1Q5T5Y3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CAMSAP1Q5T5Y3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CAMSAP1Q5T5Y3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CAMSAP1Q5T5Y3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CAMSAP1Q5T5Y3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CAMSAP1Q5T5Y3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CAMSAP1Q5T5Y3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CAMSAP1Q5T5Y3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CAMSAP1Q5T5Y3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CAMSAP1Q5T5Y3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CAMSAP1Q5T5Y3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CAMSAP1Q5T5Y3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CAMSAP1Q5T5Y3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CAMSAP1Q5T5Y3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CAMSAP1Q5T5Y3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms