Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNYL2Q5T2Q4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNYL2Q5T2Q4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNYL2Q5T2Q4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNYL2Q5T2Q4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNYL2Q5T2Q4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNYL2Q5T2Q4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms