Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C6orf10Q5SRN2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C6orf10Q5SRN2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C6orf10Q5SRN2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C6orf10Q5SRN2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C6orf10Q5SRN2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C6orf10Q5SRN2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C6orf10Q5SRN2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C6orf10Q5SRN2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C6orf10Q5SRN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C6orf10Q5SRN2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C6orf10Q5SRN2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C6orf10Q5SRN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C6orf10Q5SRN2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C6orf10Q5SRN2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C6orf10Q5SRN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C6orf10Q5SRN2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C6orf10Q5SRN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C6orf10Q5SRN2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C6orf10Q5SRN2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf10Q5SRN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf10Q5SRN2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf10Q5SRN2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf10Q5SRN2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf10Q5SRN2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms