Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRMS1LQ5PSV4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRMS1LQ5PSV4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRMS1LQ5PSV4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRMS1LQ5PSV4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRMS1LQ5PSV4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRMS1LQ5PSV4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
BRMS1LQ5PSV4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRMS1LQ5PSV4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BRMS1LQ5PSV4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms