Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD4BQ5PRF9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMD4BQ5PRF9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD4BQ5PRF9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD4BQ5PRF9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAMD4BQ5PRF9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD4BQ5PRF9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD4BQ5PRF9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD4BQ5PRF9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD4BQ5PRF9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD4BQ5PRF9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD4BQ5PRF9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD4BQ5PRF9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD4BQ5PRF9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD4BQ5PRF9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD4BQ5PRF9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD4BQ5PRF9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD4BQ5PRF9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD4BQ5PRF9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD4BQ5PRF9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD4BQ5PRF9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD4BQ5PRF9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD4BQ5PRF9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD4BQ5PRF9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD4BQ5PRF9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms