Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD3Q5JV73 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD3Q5JV73 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD3Q5JV73 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMPD3Q5JV73 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMPD3Q5JV73 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD3Q5JV73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD3Q5JV73 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD3Q5JV73 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms