Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL39P5Q59GN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL39P5Q59GN2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL39P5Q59GN2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL39P5Q59GN2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms