Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf46Q504U0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4orf46Q504U0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf46Q504U0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf46Q504U0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf46Q504U0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms