Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB8Q3ZCM7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB8Q3ZCM7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB8Q3ZCM7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB8Q3ZCM7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB8Q3ZCM7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB8Q3ZCM7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB8Q3ZCM7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB8Q3ZCM7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB8Q3ZCM7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBB8Q3ZCM7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBB8Q3ZCM7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB8Q3ZCM7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB8Q3ZCM7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB8Q3ZCM7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms