Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GNPTABQ3T906 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GNPTABQ3T906 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GNPTABQ3T906 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GNPTABQ3T906 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GNPTABQ3T906 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GNPTABQ3T906 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GNPTABQ3T906 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GNPTABQ3T906 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GNPTABQ3T906 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GNPTABQ3T906 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GNPTABQ3T906 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GNPTABQ3T906 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GNPTABQ3T906 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GNPTABQ3T906 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GNPTABQ3T906 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
GNPTABQ3T906 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GNPTABQ3T906 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GNPTABQ3T906 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GNPTABQ3T906 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GNPTABQ3T906 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms