Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT71Q3SY84 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT71Q3SY84 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT71Q3SY84 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT71Q3SY84 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT71Q3SY84 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT71Q3SY84 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT71Q3SY84 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT71Q3SY84 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT71Q3SY84 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT71Q3SY84 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT71Q3SY84 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT71Q3SY84 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT71Q3SY84 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT71Q3SY84 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT71Q3SY84 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT71Q3SY84 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT71Q3SY84 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT71Q3SY84 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT71Q3SY84 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT71Q3SY84 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT71Q3SY84 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms