Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRNQ16849 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRNQ16849 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRNQ16849 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRNQ16849 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRNQ16849 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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