Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.32■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FOXD1Q16676 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FOXD1Q16676 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
FOXD1Q16676 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FOXD1Q16676 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FOXD1Q16676 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
FOXD1Q16676 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
FOXD1Q16676 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
FOXD1Q16676 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.22■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
FOXD1Q16676 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
FOXD1Q16676 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FOXD1Q16676 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
FOXD1Q16676 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
FOXD1Q16676 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
FOXD1Q16676 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FOXD1Q16676 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
FOXD1Q16676 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
FOXD1Q16676 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
FOXD1Q16676 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.9■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
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