Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKN1Q16512 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKN1Q16512 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKN1Q16512 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKN1Q16512 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKN1Q16512 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKN1Q16512 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKN1Q16512 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKN1Q16512 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PKN1Q16512 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PKN1Q16512 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKN1Q16512 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKN1Q16512 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKN1Q16512 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PKN1Q16512 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
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