Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
E2F4Q16254 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
E2F4Q16254 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
E2F4Q16254 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
E2F4Q16254 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
E2F4Q16254 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
E2F4Q16254 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
E2F4Q16254 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
E2F4Q16254 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
E2F4Q16254 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
E2F4Q16254 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
E2F4Q16254 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms