Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF56Q15929 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF56Q15929 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF56Q15929 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF56Q15929 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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