Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms