Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCAPHQ15003 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCAPHQ15003 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCAPHQ15003 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCAPHQ15003 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCAPHQ15003 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCAPHQ15003 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCAPHQ15003 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPHQ15003 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPHQ15003 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPHQ15003 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPHQ15003 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCAPHQ15003 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPHQ15003 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCAPHQ15003 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCAPHQ15003 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCAPHQ15003 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPHQ15003 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
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