Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEDD9Q14511 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEDD9Q14511 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NEDD9Q14511 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEDD9Q14511 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEDD9Q14511 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEDD9Q14511 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEDD9Q14511 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEDD9Q14511 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEDD9Q14511 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEDD9Q14511 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEDD9Q14511 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEDD9Q14511 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
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