Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARB2Q14108 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCARB2Q14108 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARB2Q14108 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARB2Q14108 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARB2Q14108 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARB2Q14108 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARB2Q14108 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARB2Q14108 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARB2Q14108 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARB2Q14108 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARB2Q14108 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARB2Q14108 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCARB2Q14108 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARB2Q14108 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARB2Q14108 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARB2Q14108 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARB2Q14108 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARB2Q14108 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARB2Q14108 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARB2Q14108 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARB2Q14108 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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