Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CDK13Q14004 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CDK13Q14004 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CDK13Q14004 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CDK13Q14004 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CDK13Q14004 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CDK13Q14004 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
CDK13Q14004 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CDK13Q14004 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CDK13Q14004 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CDK13Q14004 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CDK13Q14004 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CDK13Q14004 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CDK13Q14004 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CDK13Q14004 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CDK13Q14004 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
CDK13Q14004 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CDK13Q14004 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
CDK13Q14004 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CDK13Q14004 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CDK13Q14004 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CDK13Q14004 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CDK13Q14004 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CDK13Q14004 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CDK13Q14004 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CDK13Q14004 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CDK13Q14004 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
CDK13Q14004 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CDK13Q14004 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CDK13Q14004 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CDK13Q14004 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42■■■■■ 4.31
CDK13Q14004 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42■■■■■ 4.31
CDK13Q14004 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42■■■■■ 4.31
CDK13Q14004 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CDK13Q14004 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CDK13Q14004 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CDK13Q14004 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CDK13Q14004 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CDK13Q14004 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CDK13Q14004 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
CDK13Q14004 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CDK13Q14004 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CDK13Q14004 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CDK13Q14004 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CDK13Q14004 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CDK13Q14004 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
CDK13Q14004 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
CDK13Q14004 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CDK13Q14004 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CDK13Q14004 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CDK13Q14004 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CDK13Q14004 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CDK13Q14004 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
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