Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FHL3Q13643 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FHL3Q13643 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FHL3Q13643 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FHL3Q13643 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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