Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTCH1Q13635 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTCH1Q13635 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTCH1Q13635 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PTCH1Q13635 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTCH1Q13635 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTCH1Q13635 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTCH1Q13635 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTCH1Q13635 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTCH1Q13635 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms