Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTCH1Q13635 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTCH1Q13635 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTCH1Q13635 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTCH1Q13635 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PTCH1Q13635 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PTCH1Q13635 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTCH1Q13635 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTCH1Q13635 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTCH1Q13635 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTCH1Q13635 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTCH1Q13635 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTCH1Q13635 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTCH1Q13635 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PTCH1Q13635 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
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