Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUL1Q13616 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL1Q13616 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CUL1Q13616 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CUL1Q13616 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CUL1Q13616 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CUL1Q13616 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CUL1Q13616 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CUL1Q13616 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CUL1Q13616 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUL1Q13616 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CUL1Q13616 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CUL1Q13616 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUL1Q13616 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUL1Q13616 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CUL1Q13616 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CUL1Q13616 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL1Q13616 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CUL1Q13616 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CUL1Q13616 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CUL1Q13616 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CUL1Q13616 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CUL1Q13616 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL1Q13616 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL1Q13616 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL1Q13616 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL1Q13616 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL1Q13616 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL1Q13616 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL1Q13616 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL1Q13616 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL1Q13616 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL1Q13616 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL1Q13616 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL1Q13616 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL1Q13616 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL1Q13616 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms