Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1AQ13522 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R1AQ13522 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R1AQ13522 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R1AQ13522 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R1AQ13522 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R1AQ13522 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R1AQ13522 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R1AQ13522 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R1AQ13522 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R1AQ13522 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R1AQ13522 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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