Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RESTQ13127 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RESTQ13127 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RESTQ13127 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RESTQ13127 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RESTQ13127 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RESTQ13127 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RESTQ13127 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RESTQ13127 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RESTQ13127 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RESTQ13127 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RESTQ13127 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RESTQ13127 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RESTQ13127 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RESTQ13127 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RESTQ13127 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RESTQ13127 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RESTQ13127 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RESTQ13127 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RESTQ13127 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RESTQ13127 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RESTQ13127 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RESTQ13127 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RESTQ13127 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RESTQ13127 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RESTQ13127 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RESTQ13127 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RESTQ13127 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RESTQ13127 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RESTQ13127 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RESTQ13127 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RESTQ13127 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RESTQ13127 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RESTQ13127 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RESTQ13127 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RESTQ13127 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RESTQ13127 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RESTQ13127 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RESTQ13127 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RESTQ13127 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RESTQ13127 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RESTQ13127 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RESTQ13127 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RESTQ13127 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RESTQ13127 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RESTQ13127 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RESTQ13127 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RESTQ13127 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RESTQ13127 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RESTQ13127 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RESTQ13127 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RESTQ13127 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RESTQ13127 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RESTQ13127 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RESTQ13127 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RESTQ13127 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RESTQ13127 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RESTQ13127 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RESTQ13127 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RESTQ13127 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RESTQ13127 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RESTQ13127 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RESTQ13127 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RESTQ13127 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RESTQ13127 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RESTQ13127 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RESTQ13127 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RESTQ13127 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RESTQ13127 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RESTQ13127 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RESTQ13127 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RESTQ13127 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RESTQ13127 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RESTQ13127 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RESTQ13127 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RESTQ13127 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RESTQ13127 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RESTQ13127 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RESTQ13127 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RESTQ13127 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RESTQ13127 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RESTQ13127 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RESTQ13127 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RESTQ13127 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RESTQ13127 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RESTQ13127 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RESTQ13127 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RESTQ13127 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
RESTQ13127 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RESTQ13127 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RESTQ13127 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RESTQ13127 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RESTQ13127 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RESTQ13127 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RESTQ13127 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RESTQ13127 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RESTQ13127 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RESTQ13127 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RESTQ13127 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RESTQ13127 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
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