Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPS1Q13098 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPS1Q13098 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GPS1Q13098 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPS1Q13098 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPS1Q13098 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GPS1Q13098 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPS1Q13098 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPS1Q13098 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPS1Q13098 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPS1Q13098 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPS1Q13098 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPS1Q13098 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPS1Q13098 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPS1Q13098 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPS1Q13098 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPS1Q13098 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPS1Q13098 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPS1Q13098 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPS1Q13098 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPS1Q13098 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPS1Q13098 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPS1Q13098 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPS1Q13098 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPS1Q13098 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPS1Q13098 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPS1Q13098 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPS1Q13098 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
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