Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
PRDM2Q13029 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
PRDM2Q13029 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
PRDM2Q13029 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
PRDM2Q13029 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
PRDM2Q13029 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
PRDM2Q13029 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
PRDM2Q13029 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
PRDM2Q13029 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
PRDM2Q13029 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
PRDM2Q13029 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
PRDM2Q13029 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
PRDM2Q13029 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
PRDM2Q13029 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
PRDM2Q13029 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
PRDM2Q13029 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
PRDM2Q13029 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
PRDM2Q13029 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC46.85■■■■■ 5.09
PRDM2Q13029 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC46.84■■■■■ 5.09
PRDM2Q13029 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
PRDM2Q13029 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
PRDM2Q13029 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
PRDM2Q13029 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
PRDM2Q13029 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
PRDM2Q13029 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.81■■■■■ 5.08
PRDM2Q13029 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
PRDM2Q13029 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
PRDM2Q13029 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
PRDM2Q13029 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
PRDM2Q13029 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
PRDM2Q13029 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
PRDM2Q13029 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC46.75■■■■■ 5.07
PRDM2Q13029 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
PRDM2Q13029 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
PRDM2Q13029 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
PRDM2Q13029 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
PRDM2Q13029 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
PRDM2Q13029 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
PRDM2Q13029 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
PRDM2Q13029 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.71■■■■■ 5.07
PRDM2Q13029 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC46.69■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
PRDM2Q13029 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC46.62■■■■■ 5.05
PRDM2Q13029 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
PRDM2Q13029 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
PRDM2Q13029 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
PRDM2Q13029 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
PRDM2Q13029 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
PRDM2Q13029 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
PRDM2Q13029 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.04
PRDM2Q13029 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
PRDM2Q13029 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
PRDM2Q13029 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
PRDM2Q13029 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
PRDM2Q13029 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
PRDM2Q13029 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
PRDM2Q13029 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
PRDM2Q13029 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.5■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC46.49■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC46.48■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC46.46■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
PRDM2Q13029 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC46.44■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
PRDM2Q13029 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
PRDM2Q13029 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
PRDM2Q13029 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
PRDM2Q13029 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
PRDM2Q13029 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
PRDM2Q13029 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
PRDM2Q13029 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
PRDM2Q13029 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
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