Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN31Q12999 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN31Q12999 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN31Q12999 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN31Q12999 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN31Q12999 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN31Q12999 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN31Q12999 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms